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FAQ-WB

Weatern blot相关问题

1. Q:蛋白提取后可以存放多久

A:蛋白提取后-80℃可保存一年。建议分装保存,避免反复冻融。

2. Q:蛋白提取时用进行超声破碎么?

A:一般建议进行超声处理,这样可使样本裂解更充分,是其实对于核蛋白、核染色质相关蛋白等难提取、复杂的蛋白,超声处理是关键因素。

3. Q:做组织样品蛋白的western的时候,提取蛋白有什么特别注意的吗?

A:必须进行研磨、匀浆处理,最好做超声处理,使蛋白质溶解度会更好,离心要充分组织中的蛋白酶活性更强,需要加入抑制蛋白酶活性的抑制剂,防止蛋白降解。

4. Q:蛋白含量测定方法的选择。

A:提取的样品中若含有去垢剂则需要选用BCA法进行蛋白浓度测定,若样品中含有螯合剂(EDTAEGTA)、还原剂(DTT,巯基乙醇)和脂类等,则需要选用Bradford法进行蛋白浓度测定。

5. QWB实验中样品上样量是多少?

A细胞裂解物或组织匀浆的总蛋白的上样量一般为 20 - 40 μg,纯化蛋白的上样量一般为为 10 - 100 ng

6. QWB实验中一般需要多少个细胞?

A:一般5×106足够。但要看是哪种细胞,有的细胞的体积就很小,而有的细胞则铺得很开。常规做WB一个孔道上样要105个细胞。但也和目的蛋白及提取的方式有关。如果是膜蛋白或是某细胞器内分布的蛋白细胞数得增多。

7. Q:电泳后为什么会出现“微笑”或“倒微笑”条带?

Aa)"微笑"是因为灌胶的时候冷却不均匀,中间部分冷却不好,导致凝胶中的分子有不同的迁移率所致。

b)“倒微笑“现象常常是由于垂直电泳时电泳槽的装置不合适引起的,特别是当凝胶和玻璃板组成的三明治底部有气泡或靠近隔片的凝胶聚合不完全,加APSTEMED后应该混合均匀。

c)电泳和转膜温度过高,点样量太多或每孔点样量不均匀,电泳电压不稳定或过高都可能引起条带不整齐的现象。

8. Q:转膜注意事项?

Aa)滤纸、胶、膜之间的大小,一般是滤纸≥膜≥胶。

b)滤纸、胶、膜之间千万不能有气泡,气泡会造成短路。

c)保持膜的湿润,若FVDF膜干燥,需要重新用甲醇活化。

9. Q:脱脂奶粉和 BSA 封闭有区别吗?

A一般来讲,BSA 会产生更清晰的结果,因为 BSA 含有较少的蛋白,抗体与之发生交叉反应的概率较低。但并非总是如此,有些抗体在脱脂奶粉中的封闭的效果更好,因为脱脂奶粉中含有更多种类的封闭蛋白,能封闭更多不同类型的蛋白质

10. Q:一抗二抗用什么稀释?

A:一抗可用封闭液稀释。二抗可用TBST稀释,若感觉背景高也可以用封闭液进行稀释。若使用商品化的WB抗体稀释液,则需要注意稀释液中是否还有防腐剂(NaN3),若含有则不能稀释HRP标记二抗。

11. Q:目的蛋白分子量为何与实际不符?

Aa)翻译后修饰:蛋白发生如磷酸化、糖基化等翻译后修饰时分子量会增加;

b)翻译后剪切:蛋白发生剪切时分子量会降低,某些蛋白在合成时是作为前提蛋白合成的,然后剪切形成活性形式

c)剪切异构体:同一基因经不同剪切方式可能产生不同大小的蛋白

d)多聚体:比如蛋白二聚化;

e)电泳,胶浓度,蛋白Marker等因素也会影响是实际蛋白分子量的判断。

12. Q:内参抗体的选择

A

1.内参与目的蛋白分子量最好相差5kD以上

2.不同组织样本在选择内参时存在一定差别

适应范围

名称

理论分子量

胞浆或全蛋白

β-actin

43kDa

GAPDH

36kDa

Tubulin

49kDa

细胞核

TBP

38kDa

PCNA

29kDa

Histone-H3

15kDa

细胞核膜

LaminA/C

65-75kDa

LaminB1

66kDa

膜蛋白

ATP1A1

74/110/113kDa

线粒体

COX4I1

20kDa

VDAC1

31kDa

 

13. QWB实验结果条带很弱或者无目的条带

A

可能原因

参考解决方案

一抗二抗不匹配

看清抗体来源的动物种属

一抗/二抗浓度低

增加抗体浓度、延长孵育时间

转膜不充分

转膜后染色看转膜效果,转模时装置和方向是否正确

洗膜过度

洗膜时间不要太长

目的蛋白量较少

提高上样量,裂解液中加入蛋白酶抑制剂

蛋白降解

重新制备样品,控制电泳和转膜的温度

过度封闭

可考虑更换封闭液,缩短封闭时间

二抗标记的酶(HRP)失效

检查是否使用叠氮化钠的试剂或者容器

14. QWB实验结果非特异性条带多

A

可能原因

参考解决方案

目的蛋白有多个剪切本

查阅文献或进行生物信息学分析

样本提取过程中目的蛋白降解

提取蛋白时加蛋白酶抑制剂,冰上操作。

一抗浓度过高

降低一抗浓度,可减少非特异性条带

一抗特异性不高

更换抗体

目的蛋白有多个修饰位置

查阅文献或进行生物信息学分析

二聚体或多聚体存在

增加蛋白质变性过程及强度

底物显色与曝光时间过长

缩短显色及曝光的时间

15. QWB实验结果背景偏高

A

可能原因

参考解决方案

未进行特异性封闭货封闭不充分

延长封闭时间,更换封闭液

孵育温度过高

4℃孵育

一抗浓度过高

降低一抗浓度,可减少非特异性条带

未结合蛋白质洗涤不充分

增加洗涤次数

膜干燥

整个过程保持膜湿润

一抗或二抗与封闭剂有交叉反应

在孵育和洗涤液中加入温和去污剂如吐温-20。脱脂奶粉含有酪蛋白,该蛋白本身就是一种磷酸化蛋白,会结合磷酸化特异性抗体而易产生 高背景。使用 BSA 代替奶粉作为封闭剂。

16. QWB实验中其他常见的问题

A

可能出现问题

原因

参考解决方案

相同蛋白杂交出现大小不均匀条带

制备凝胶时凝胶凝固太快,致使泳道中丙烯酰胺的比例不均匀

调整促凝剂的用量

目的条带染色过高/过低

分离不彻底

分子量大的蛋白用低浓度胶,分子量小的蛋白用高浓度胶

深背景出现白色条带

一抗或二抗加入过多

稀释抗体的浓度

背景有黑色斑点

抗体结合了封闭剂

过滤封闭剂

背景有不均匀的白色斑点

转膜时膜上有气泡或抗体在膜上分布不均

转膜过程中尽量去除气泡,抗体孵育时保持摇动

 

 


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